Ćwiczenia z Bioinformatyki odbywają się w ramach II Pracowni Fizycznej
(Pracowni Systemów Pomiarowych, kierownik: dr E.Pawłowska)
Dostępne na tej stronie materiały przeznaczone są dla studentów Fizyki z Informatyką i Informatyki Stosowanej
oraz studentów Fizyki Medycznej jako uzupełnienie ćwiczeń z Bioinformatyki i Biofizyki.
Terminy i sale
Ćwiczenia w roku akademickim 2006/2007 prowadzą:
dr E. Banachowicz - Zakład Biofizyki Molekularnej, p. 202
mgr Paweł Zawadzki - Zakład Biofizyki Molekularnej, p. 200 ; Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej,Wydz. Biologii p
kontakt: Paweł Zawadzki
Pierwsze zajęcia Laboratorium Bioinformatycznego odbywają się w sali 84 (Laboratorium Biofizyczne)
natomiast pozostale w sali 46. (Pracownia Bioinformatyczna)
we wtorki: 8.30 - 11.30 (I grupa)
w czwartki: 18.30 - 11.30 (II grupa)
Warunek zaliczenia ćwiczeń
Zaliczenie ćwiczenia uzależnione jest od:
oceny z kolokwium wejściowego (warunek uczestnictwa w ćwiczeniach)
udziału we wszystkich zajęciach
poprawnego rozwiązania przydzielonego zadania
Tematyka zajęć
Celem ćwiczeń jest opanowanie wybranych narzędzi bioinforamtycznych wykorzystywanych do analizowania
sekwencji DNA i białek oraz przewidywania i wizualizacji ich struktury.
Rozwiązywane w czasie ćwiczeń zadania dotyczą:
sposobów porównywania sekwencji DNA lub białek, szukaniu mutacji i ocenie jej skutków
Tłumaczenia kodu genetycznego
identyfikowania "nieznanego" materiału genetycznego (pochodzenia i funkcji)
porównawczego modelowania struktury przestrzennej białek.
Zakres podstawowej wiedzy z biologii molekularnej i biochemii wymagany przed przystąpieniem do ćwiczeń określony
został w ZAGADNIENIACH.
Przykładowe pytania z kolokwium wejściowego.